More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0886 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  100 
 
 
557 aa  1106    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.29 
 
 
558 aa  331  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.52 
 
 
555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.72 
 
 
554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.19 
 
 
536 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.19 
 
 
536 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  37.65 
 
 
538 aa  269  8e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  34.4 
 
 
521 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  33.67 
 
 
521 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.69 
 
 
438 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  30.63 
 
 
427 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.21 
 
 
593 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.54 
 
 
610 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  32.35 
 
 
596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.42 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.45 
 
 
607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.97 
 
 
605 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.84 
 
 
626 aa  123  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  35.98 
 
 
595 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  35.98 
 
 
595 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  32.52 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.14 
 
 
594 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.25 
 
 
597 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.25 
 
 
597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  33.93 
 
 
601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.67 
 
 
590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  31.93 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.65 
 
 
624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  24.08 
 
 
590 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.57 
 
 
586 aa  110  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.89 
 
 
604 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.76 
 
 
618 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.48 
 
 
615 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.71 
 
 
610 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  29.23 
 
 
868 aa  99.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.05 
 
 
443 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  26.15 
 
 
872 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 
864 aa  95.1  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0916  hypothetical protein  30.36 
 
 
685 aa  95.1  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0756379 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  29.09 
 
 
820 aa  94.4  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 
828 aa  93.2  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  25.94 
 
 
851 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  28.9 
 
 
874 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  29.22 
 
 
848 aa  91.3  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  29.5 
 
 
793 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.75 
 
 
442 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  26.28 
 
 
823 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 
870 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 
793 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  26.44 
 
 
873 aa  88.6  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19604  predicted protein  28 
 
 
363 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  27.55 
 
 
887 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  26.3 
 
 
853 aa  88.6  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 
872 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 
872 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  26.05 
 
 
897 aa  87  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  24.54 
 
 
893 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  25.27 
 
 
848 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  27.63 
 
 
863 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  24.04 
 
 
896 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 
869 aa  85.1  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  25.38 
 
 
893 aa  84.7  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  24.9 
 
 
885 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  24.9 
 
 
886 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  27.34 
 
 
873 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  23.81 
 
 
888 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  23.81 
 
 
888 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
891 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
891 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 
846 aa  83.6  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
939 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
939 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
939 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 
857 aa  83.6  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
939 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  25.27 
 
 
870 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  27.59 
 
 
904 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  20.78 
 
 
859 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  25.47 
 
 
917 aa  83.2  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  24.62 
 
 
927 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.63 
 
 
450 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 
860 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  26.34 
 
 
882 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 
938 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 
872 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 
884 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 
884 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  23.64 
 
 
910 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  24.52 
 
 
869 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  23.19 
 
 
927 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  22.86 
 
 
881 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  26.1 
 
 
883 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  29.39 
 
 
1186 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 
903 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  26.34 
 
 
931 aa  81.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.32 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  24.51 
 
 
885 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 
819 aa  80.9  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 
860 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  25.78 
 
 
817 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>