More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0625 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  100 
 
 
105 aa  218  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  97.14 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  97.14 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  96.19 
 
 
123 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  95.24 
 
 
187 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  95.24 
 
 
133 aa  206  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  95.24 
 
 
133 aa  206  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  95.24 
 
 
123 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  94.29 
 
 
187 aa  205  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  66.02 
 
 
134 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2662  transposase IS200-family protein  57.58 
 
 
136 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0127  ISCpe2, transposase orfA  91.38 
 
 
66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1030  ISCpe2, transposase orfA  93.88 
 
 
55 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.28283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0710  ISCpe2, transposase orfA  93.02 
 
 
43 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  42.71 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  42 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  42.72 
 
 
136 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0888  ISCpe2, transposase orfA  90.7 
 
 
43 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.306894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  39.58 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  37 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  37 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  35 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  35 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  44 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  39.58 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  43.48 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  36.36 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  40.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  39.58 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0866  hypothetical protein  36 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1740  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.431395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1829  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.615719 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1907  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  33 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  40 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  42.39 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  33.66 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1878  transposase IS200-family protein  42.72 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  36.63 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  35.79 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  35.79 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  41.41 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  36.89 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  39 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  37.86 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  41.3 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  34.74 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  33.66 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  34.95 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  34.95 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  39.81 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  39.81 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  39.81 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  39.81 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  39.81 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  32.32 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  40.59 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  38.38 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  35.24 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  36.63 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  36.19 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  33 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  38.83 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  35.64 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0445  transposase IS200-family protein  38.61 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  38.83 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  32 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  32.67 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  28.85 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  28.85 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  35.58 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  39.6 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  33.98 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  32.67 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  32.67 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  32.67 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  32.67 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  35.92 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0972  transposase IS200-family protein  34.62 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.246434  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  34.29 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  27.88 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0151  transposase IS200-family protein  33.65 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.266582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  32.04 
 
 
128 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  29.52 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  37.11 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  30.21 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  36.08 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  27 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  32.04 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>