More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2136 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  100 
 
 		 783 aa  1588    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  99.11 
 
 		 783 aa  1572    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  37.68 
 
 		 839 aa  519  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  36.65 
 
 		 848 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  36.04 
 
 		 847 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  35.81 
 
 		 835 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  36.55 
 
 		 872 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  35.32 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  36.74 
 
 		 886 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  36.16 
 
 		 817 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  37.59 
 
 		 783 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  33.29 
 
 		 836 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  32.18 
 
 		 862 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  32.47 
 
 		 838 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  34.03 
 
 		 810 aa  425  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  33.05 
 
 		 783 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  30.65 
 
 		 828 aa  369  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.3 
 
 		 837 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  30.38 
 
 		 832 aa  356  7.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  30.31 
 
 		 873 aa  352  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  31.28 
 
 		 839 aa  351  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  30.6 
 
 		 835 aa  346  8.999999999999999e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  29.07 
 
 		 833 aa  345  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  28.69 
 
 		 841 aa  344  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  29.29 
 
 		 823 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  28.96 
 
 		 835 aa  337  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  29.13 
 
 		 825 aa  333  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  29.23 
 
 		 852 aa  333  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  28.69 
 
 		 847 aa  332  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  30.75 
 
 		 805 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  27.72 
 
 		 826 aa  330  9e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  28.38 
 
 		 818 aa  327  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  33.81 
 
 		 767 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  28.85 
 
 		 840 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  29.88 
 
 		 826 aa  324  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  31.53 
 
 		 878 aa  319  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  32.2 
 
 		 716 aa  313  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  26.84 
 
 		 851 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  27.37 
 
 		 877 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  30.73 
 
 		 876 aa  311  4e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  44.07 
 
 		 790 aa  302  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  31.72 
 
 		 822 aa  301  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  30.17 
 
 		 790 aa  300  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  31.69 
 
 		 834 aa  300  9e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  32.47 
 
 		 723 aa  294  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  31.7 
 
 		 736 aa  294  5e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  31.07 
 
 		 722 aa  292  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  27.39 
 
 		 843 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  34.39 
 
 		 792 aa  286  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  29.08 
 
 		 792 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  37.56 
 
 		 790 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  28.96 
 
 		 790 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  42.81 
 
 		 746 aa  260  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  41.19 
 
 		 411 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  34.56 
 
 		 640 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  43.04 
 
 		 404 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  33.46 
 
 		 629 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  35.06 
 
 		 654 aa  244  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  45.99 
 
 		 411 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  41.98 
 
 		 419 aa  242  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  41.8 
 
 		 409 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  40.32 
 
 		 407 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  43.33 
 
 		 404 aa  241  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  34.99 
 
 		 667 aa  241  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  34.99 
 
 		 667 aa  241  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  34.99 
 
 		 667 aa  241  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  34.99 
 
 		 653 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  34.99 
 
 		 653 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  34.36 
 
 		 654 aa  240  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  41.48 
 
 		 409 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  32.58 
 
 		 672 aa  240  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  34.8 
 
 		 667 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  37.78 
 
 		 696 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  34.8 
 
 		 653 aa  239  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  34.36 
 
 		 654 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  36.04 
 
 		 413 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  34.36 
 
 		 654 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  34.36 
 
 		 654 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  34.36 
 
 		 654 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  34.8 
 
 		 653 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  33.02 
 
 		 652 aa  238  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  31.39 
 
 		 669 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  40.59 
 
 		 403 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  33.52 
 
 		 667 aa  237  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  42.11 
 
 		 406 aa  237  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  32.52 
 
 		 622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  38.49 
 
 		 667 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  42.22 
 
 		 406 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  32.52 
 
 		 666 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  32.52 
 
 		 666 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  33.27 
 
 		 621 aa  233  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  31.38 
 
 		 667 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  41.64 
 
 		 420 aa  231  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  38.78 
 
 		 430 aa  231  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4811  peptidase U32  31.78 
 
 		 668 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0604959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  36.24 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  42.91 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  38.49 
 
 		 410 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  31.19 
 
 		 692 aa  229  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  33.83 
 
 		 662 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>