More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02220 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02220  grpe protein, putative  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  35.32 
 
 
222 aa  116  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.86 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 
230 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 
230 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  38.1 
 
 
188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  38.6 
 
 
210 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
222 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  38.99 
 
 
204 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  39.18 
 
 
208 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.6 
 
 
210 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.35 
 
 
202 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.35 
 
 
202 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  40.46 
 
 
206 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  40.4 
 
 
226 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.87 
 
 
204 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  39.51 
 
 
207 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  39.51 
 
 
206 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  36.9 
 
 
181 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  40.51 
 
 
203 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.5 
 
 
217 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  39.24 
 
 
202 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
206 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
205 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.48 
 
 
210 aa  98.6  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.75 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  38.99 
 
 
197 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  41.86 
 
 
157 aa  95.1  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  41.13 
 
 
187 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  35 
 
 
210 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  39.01 
 
 
201 aa  91.7  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  32.3 
 
 
213 aa  91.7  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06248  mitochondrial co-chaperone GrpE, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13040)  33.2 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00156969  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  35.87 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
194 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  37.91 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  31.76 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  35.18 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  31.01 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  32.5 
 
 
181 aa  82  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  32.93 
 
 
182 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  34.97 
 
 
187 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  33.75 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  33.75 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  34.57 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  30.89 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  32.34 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  32.74 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  35.58 
 
 
180 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  30.89 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  35.22 
 
 
175 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  32.93 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  33.52 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  36.99 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  32.56 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  32.28 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0168  co-chaperone GrpE  32.56 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  32.04 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  34.9 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  32.37 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  31.21 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  29.55 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  31.32 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  32.07 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  30.18 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  32.76 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  31.82 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  31.61 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  35.86 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  31.82 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  31.25 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>