More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01740 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  100 
 
 
483 aa  968    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  48.32 
 
 
456 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  41.95 
 
 
465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  50.72 
 
 
325 aa  245  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  50.37 
 
 
332 aa  240  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  48.33 
 
 
323 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  46.44 
 
 
323 aa  228  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  45.86 
 
 
323 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  44.57 
 
 
323 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  45.72 
 
 
323 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  45.72 
 
 
323 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  42.75 
 
 
323 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  43.87 
 
 
323 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  43.12 
 
 
323 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  43.12 
 
 
323 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  43.4 
 
 
309 aa  205  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  41.89 
 
 
323 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  42.64 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  41.51 
 
 
323 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  40.75 
 
 
323 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  40 
 
 
323 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  40.38 
 
 
323 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  40 
 
 
323 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  40 
 
 
323 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  39.41 
 
 
311 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  38.72 
 
 
323 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  37.59 
 
 
323 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  38.66 
 
 
313 aa  156  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.62 
 
 
322 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  36.98 
 
 
370 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  36.98 
 
 
370 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  36.98 
 
 
370 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  36.98 
 
 
370 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  36.98 
 
 
370 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 
323 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  36.56 
 
 
323 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 
323 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 
323 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  36.56 
 
 
323 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 
323 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 
323 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 
323 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  36.84 
 
 
323 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  38.35 
 
 
323 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  36.2 
 
 
323 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.21 
 
 
322 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  37.55 
 
 
330 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  38.2 
 
 
323 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.46 
 
 
322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  37.97 
 
 
333 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  36.68 
 
 
335 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  35.64 
 
 
358 aa  147  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  37.22 
 
 
331 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  35.58 
 
 
343 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.59 
 
 
322 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  37.92 
 
 
331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  37.92 
 
 
331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  37.92 
 
 
331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  38.11 
 
 
323 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.33 
 
 
322 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.08 
 
 
324 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  37.64 
 
 
332 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  33.96 
 
 
326 aa  143  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  34.07 
 
 
345 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  36.84 
 
 
323 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  35 
 
 
336 aa  143  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  37.22 
 
 
322 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  34.07 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.25 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.1 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 
323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  34.59 
 
 
348 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  32.61 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  33.83 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  36.6 
 
 
323 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  36.7 
 
 
344 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  35.96 
 
 
337 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  37.22 
 
 
322 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  36.47 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  34.04 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.09 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  34.04 
 
 
340 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.45 
 
 
322 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.58 
 
 
322 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.47 
 
 
322 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  33.69 
 
 
356 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.96 
 
 
322 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.09 
 
 
322 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.94 
 
 
339 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.21 
 
 
340 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.47 
 
 
322 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  36.23 
 
 
323 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  35.21 
 
 
340 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.21 
 
 
322 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  36.47 
 
 
331 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  35.85 
 
 
323 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.09 
 
 
322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  35.9 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 
331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>