33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00220 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01339  ubiquitin-protein ligase (Rsp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09500)  63.42 
 
 		 821 aa  1032    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00220  ubiquitin-protein ligase, putative  100 
 
 		 833 aa  1727    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.311807  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65602  predicted protein  60.89 
 
 		 776 aa  1007    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.62617  normal  0.190036 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  46.56 
 
 		 3268 aa  365  2e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01966  ubiquitin-protein ligase (Tom1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10780)  44.76 
 
 		 4022 aa  363  9e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01260  ubiquitin-protein ligase, putative  43.73 
 
 		 3251 aa  332  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52147  predicted protein  42.21 
 
 		 406 aa  307  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41898  predicted protein  42.21 
 
 		 406 aa  307  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12562  predicted protein  40.54 
 
 		 384 aa  306  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637847  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14177  predicted protein  38.25 
 
 		 370 aa  253  7e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324881  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14345  predicted protein  39.83 
 
 		 367 aa  245  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01540  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1063 aa  201  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00444  ubiquitin-protein ligase (Hul4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04640)  33.6 
 
 		 1090 aa  190  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358914  normal  0.139681 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66630  predicted protein  33.33 
 
 		 950 aa  189  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_42123  predicted protein  35.63 
 
 		 343 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43113  predicted protein  30.91 
 
 		 443 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  hitchhiker  0.00922136 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15627  predicted protein  34.67 
 
 		 315 aa  168  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254802  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83187  ubiquitin-protein ligase (E3)  29.37 
 
 		 977 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.346459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14843  predicted protein  32.16 
 
 		 283 aa  151  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03999  IQ and HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04210)  27.87 
 
 		 1222 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41776  predicted protein  26.91 
 
 		 376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.282531  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36723  predicted protein  26.91 
 
 		 376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00193554 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01874  HECT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04450)  34.86 
 
 		 1146 aa  114  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39499  predicted protein  25.55 
 
 		 520 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00243208 
 
 
-
 
NC_006686  CND03680  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 1843 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421578  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31158  predicted protein  25.55 
 
 		 781 aa  95.5  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000507428  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38506  predicted protein  30.89 
 
 		 192 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432889  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01746  ubiquitin-protein ligase Ufd4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08880)  23.68 
 
 		 1820 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0719286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32908  ubiquitin--protein ligase  24.92 
 
 		 1702 aa  82  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0606502  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_52750  ubiquitin-protein ligase 1  30.61 
 
 		 166 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49065  predicted protein  24.22 
 
 		 2083 aa  51.6  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32201  predicted protein  35.63 
 
 		 1265 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0196343  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8959  predicted protein  30.26 
 
 		 117 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>