34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05400 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  100 
 
 
158 aa  328  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  78.85 
 
 
156 aa  254  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  70.25 
 
 
159 aa  224  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  49.69 
 
 
165 aa  155  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  45.81 
 
 
158 aa  140  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  37.5 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  35 
 
 
131 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  34.48 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  38.1 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  35 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  36.9 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  33 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  36.9 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  36.9 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  29.25 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  33 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  31.43 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  33.94 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  31.37 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  32 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  31.19 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  31.9 
 
 
136 aa  61.6  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  34.02 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  32.23 
 
 
125 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  29.82 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  29.91 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  31.65 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  32.61 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  32.61 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  31.96 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  31.91 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  29.81 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  30.61 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.238981 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04695  Woronin body major protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P8K9]  25 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000213252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>