More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02600 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  51.56 
 
 		 280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.96 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  40.99 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  41.33 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  40.44 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  40.44 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  39.64 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.73 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.7 
 
 		 967 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  37.67 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  39.73 
 
 		 291 aa  148  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.82 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.81 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.39 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30193  enoyl CoA hydratase  33.33 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  34.04 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  34.04 
 
 		 289 aa  109  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.08 
 
 		 657 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.16 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  27.75 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  28.02 
 
 		 297 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  28.02 
 
 		 297 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  28.02 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  28.02 
 
 		 297 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.96 
 
 		 659 aa  97.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  28.02 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  28.02 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  28.02 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.21 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.91 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  30.62 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 262 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.71 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.09 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6106  short chain enoyl-CoA hydratase  33.78 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  26.87 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.32 
 
 		 661 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  30.84 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>