More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0968 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0968  sensor histidine kinase  100 
 
 
429 aa  834    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.130754  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0924  sensor histidine kinase  95.8 
 
 
429 aa  767    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0898  sensor histidine kinase  97.2 
 
 
429 aa  769    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0803  two-component sensor histidine kinase  47.21 
 
 
429 aa  332  6e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.916212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0402  sensory trasnduction histidine kinase  32 
 
 
449 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0208594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1874  ATP-binding region ATPase domain protein  34.77 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1558  histidine kinase  29.87 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.160407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0537  sensory trasnduction histidine kinase  41.74 
 
 
290 aa  136  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
433 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  32.87 
 
 
352 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  28.63 
 
 
906 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
458 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 
675 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
418 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29 
 
 
476 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  27.18 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  27.18 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  27.61 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  31.02 
 
 
581 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  28.11 
 
 
431 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
604 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
445 aa  93.2  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  32.57 
 
 
581 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
733 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  27.65 
 
 
431 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  27.65 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
581 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0560  histidine kinase  27.57 
 
 
341 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0919197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
584 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
576 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  30.84 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  30.77 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
431 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  31.53 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  32.29 
 
 
465 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  27.19 
 
 
431 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 
468 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  35.91 
 
 
467 aa  90.5  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  27.19 
 
 
431 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  30.14 
 
 
432 aa  90.1  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
321 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  27.19 
 
 
431 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
473 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
584 aa  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  28.05 
 
 
344 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  28.05 
 
 
347 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  28.96 
 
 
402 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
585 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
350 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0543  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  27.19 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  29.6 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  27.19 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  29.39 
 
 
494 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  27.69 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  32.74 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
590 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 
1261 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
449 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  27.44 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  30.09 
 
 
400 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  27.6 
 
 
591 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
581 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  26.25 
 
 
488 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
442 aa  87  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  30.45 
 
 
537 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  25.87 
 
 
540 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
422 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0381  histidine kinase  30.8 
 
 
430 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  32.26 
 
 
1337 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  30.7 
 
 
356 aa  86.7  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
364 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
585 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.77 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  28.05 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  28.09 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
716 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
590 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  26.92 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  28.68 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  28.08 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  29.03 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  29.03 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  29.03 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  25.6 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  29.03 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  20.96 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>