255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3404 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  291  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  62 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  59.73 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  57.33 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  54.67 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  54.67 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  52.67 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0980  GatB/YqeY domain-containing protein  55.86 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.791367 
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  49.31 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  46.26 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  43.92 
 
 		 513 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  44.97 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  41.61 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  40.4 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  39.6 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  44 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.67 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  42.28 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  41.89 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  43.14 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  42.31 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  41.33 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  36.67 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  38.93 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  43.33 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  38.82 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  39.74 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  42.36 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  36.18 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  42.57 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.58 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.67 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.67 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  94.4  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.18 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 		 149 aa  94  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  41.06 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  44.83 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  36.18 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  37.33 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  43.33 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  38.41 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  42 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  37.75 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1387  GatB/Yqey domain-containing protein  40.38 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000956621  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  36.67 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  36.91 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  39.58 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  40 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  36 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  37.16 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  36.3 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  42 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  42 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  36.67 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  37.84 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  36.42 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  42 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  42 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  38.51 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  35.33 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  36.55 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  41.33 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  43.27 
 
 		 173 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  37.04 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  40.67 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  37.75 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  41.67 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  35.76 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  36.24 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  35.76 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  34.67 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  33.56 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  34.67 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  39.22 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  38.56 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  37.5 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  34 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  36.18 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  40.27 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>