More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3261 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 287 aa  599  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.46 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 382 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.61 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  36.65 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  37.27 
 
 		 280 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  30.08 
 
 		 392 aa  95.9  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.82 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  34.97 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  34.08 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.35 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  33.9 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  32.84 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  29.86 
 
 		 377 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  33.17 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  30.7 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  30.15 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  25.59 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4278  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0457  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.95 
 
 		 426 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.566128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0451  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.95 
 
 		 426 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  32.37 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  34.08 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  33.77 
 
 		 365 aa  86.7  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1690  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 319 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.68 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0565  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.567073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.84 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 1012 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  35.1 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  26.83 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  32.68 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3810  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.21 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.22407 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  31.28 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  30.12 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  26.4 
 
 		 559 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2291  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.18 
 
 		 416 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  34.6 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.31 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.3 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3479  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.4 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.949619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1838  cyclopropane fatty acid synthase  31.58 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.89 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3871  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.18 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0580  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.54 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0941  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5066  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.27 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3473  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.81 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.65 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.22 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.71 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  23.81 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.05 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.64 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2012  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.99 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  33.02 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.59 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  29.65 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2017  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.6 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.421548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>