48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1690 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1690  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 319 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.73 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  28.45 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 271 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  27.91 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  29.44 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1336  O-methyltransferase family protein  26.11 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0282935  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.13 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  34.75 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  33.64 
 
 		 282 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 271 aa  49.3  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  26.51 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  26.42 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  23.21 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  27.85 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  24.29 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  36.7 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13866  hypothetical protein  32.52 
 
 		 191 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 208 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  25 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.57 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  25.9 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  21.63 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  27.59 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>