More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3130 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3130  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  706    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.828286  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3993  pirin domain-containing protein  56.18 
 
 
366 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347304  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6112  Pirin domain protein  54.52 
 
 
339 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5250  Pirin domain protein  54.94 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00018028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2634  pirin domain-containing protein  55.79 
 
 
339 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00219854  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4775  Pirin-like  54.84 
 
 
363 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.054663  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2659  pirin domain-containing protein  51.82 
 
 
335 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.12893 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.4 
 
 
348 aa  371  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0908  pirin domain-containing protein  51.66 
 
 
348 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3315  Pirin domain protein  51.03 
 
 
347 aa  359  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3965  pirin domain-containing protein  50.73 
 
 
347 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  0.318513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4605  pirin domain-containing protein  51.52 
 
 
349 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738915  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34715  predicted protein  47.32 
 
 
352 aa  313  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343605  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29089  predicted protein  47.08 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  40.08 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  37.96 
 
 
288 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  38.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  37.92 
 
 
290 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  38.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  38.11 
 
 
288 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  38.11 
 
 
288 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  37.7 
 
 
288 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 
288 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  38.87 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  36.78 
 
 
295 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  36.67 
 
 
288 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  37.1 
 
 
288 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  40.49 
 
 
290 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  40.49 
 
 
290 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  37.3 
 
 
288 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  40.49 
 
 
290 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  37.7 
 
 
283 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  40.49 
 
 
290 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  40.49 
 
 
290 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  40.49 
 
 
290 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
290 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  35 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  37.7 
 
 
290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  37.76 
 
 
282 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  33.55 
 
 
318 aa  153  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  37.29 
 
 
290 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  36.1 
 
 
282 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  36.67 
 
 
305 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  36.67 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
290 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  39.26 
 
 
290 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  37.19 
 
 
293 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  35.77 
 
 
295 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  35.63 
 
 
293 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
290 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  38.84 
 
 
290 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  38.84 
 
 
290 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  37.6 
 
 
289 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  37.6 
 
 
289 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  37.6 
 
 
289 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  40.08 
 
 
337 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  39.34 
 
 
292 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  35.51 
 
 
286 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  35.51 
 
 
286 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  35.51 
 
 
286 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  35.51 
 
 
286 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  35.51 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.17 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  38.93 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  35.22 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  36.1 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  34.94 
 
 
293 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  36.1 
 
 
285 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  36.21 
 
 
283 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.45 
 
 
284 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  34.3 
 
 
293 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  37.14 
 
 
288 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.83 
 
 
293 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  35.68 
 
 
292 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.05 
 
 
299 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  36.93 
 
 
284 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  36.58 
 
 
298 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  35.51 
 
 
286 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  37.65 
 
 
290 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  34.1 
 
 
328 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  37.65 
 
 
290 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  36.59 
 
 
285 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  36.99 
 
 
284 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  34.3 
 
 
290 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  37.3 
 
 
296 aa  142  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  36.22 
 
 
298 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  35.89 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  34.58 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  35.25 
 
 
286 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  34.4 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  36.33 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  34.73 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  31.31 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>