31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1860 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  100 
 
 		 318 aa  642    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  37.47 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.81 
 
 		 1679 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1389 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1059 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  36.19 
 
 		 386 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  32.53 
 
 		 428 aa  106  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  35.98 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  35.26 
 
 		 484 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  37.91 
 
 		 618 aa  95.9  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  33.33 
 
 		 424 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  39.04 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  28.79 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  32.63 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  30.84 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  26.98 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  35.44 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  27.83 
 
 		 816 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  38.52 
 
 		 581 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.72 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  34.36 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  28.07 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.08 
 
 		 565 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 		 535 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.07 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  32.48 
 
 		 473 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  31.07 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  29.81 
 
 		 581 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.81 
 
 		 539 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04856  hypothetical protein  30.36 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  26.9 
 
 		 1335 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>