157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1384 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1384  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1320  phosphatidylserine decarboxylase  57.25 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00632979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1554  phosphatidylserine decarboxylase  54.55 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1154  phosphatidylserine decarboxylase  53.93 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0928124  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0573  phosphatidylserine decarboxylase  52.99 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.864728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0863  phosphatidylserine decarboxylase  53.44 
 
 		 266 aa  254  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0934  phosphatidylserine decarboxylase  53.44 
 
 		 266 aa  254  8e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0997  phosphatidylserine decarboxylase  51.91 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0749  phosphatidylserine decarboxylase  44.57 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1033  phosphatidylserine decarboxylase  43.35 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.339305  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  33.46 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  30.08 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  31.13 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  30.68 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  32 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  32.01 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  32.55 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  32.52 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  28.73 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  28.73 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  29.15 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  31.09 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  29.52 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  31.37 
 
 		 286 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  31.34 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  29.6 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  29.88 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  31.2 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  31.05 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  33.78 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  31.29 
 
 		 325 aa  128  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  27.51 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  29.92 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  31.05 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  28.73 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  28.89 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  29.53 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  29.13 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  31.07 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  28.89 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  30.47 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  29.69 
 
 		 286 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  27.31 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  31.37 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  30.11 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  30.11 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  28.06 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  28.21 
 
 		 287 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  28.21 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  29.86 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  27.04 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  29.6 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  29.3 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  30.11 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  26.81 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  28.33 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  27.84 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  30.4 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  29.96 
 
 		 289 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  28.92 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  29.84 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  26.37 
 
 		 610 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  26.37 
 
 		 613 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  29.18 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  29.18 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  29.18 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  31.37 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  29.6 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  25.2 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  26.12 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  28.36 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  31.76 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  30.74 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  26.37 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  27.95 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  26.19 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  26.37 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  28.79 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  28.79 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  28.79 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  29.77 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  28.79 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  28.79 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  26.91 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6208  putative phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000986716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>