155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1093 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  100 
 
 
148 aa  283  7e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  61.26 
 
 
142 aa  147  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  57.66 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1119  sec-independent translocase  53.24 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000270209  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0664  sec-independent translocase  45.45 
 
 
130 aa  111  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0607  sec-independent translocase  53.33 
 
 
135 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0682  sec-independent translocase  53.33 
 
 
138 aa  103  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1452  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.44 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.401739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  36.73 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1655  sec-independent translocase  36.18 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  31.78 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  32.08 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  33.33 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.82 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  30.84 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  28 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.96 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  28 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  28 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  26.14 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  28 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  27.19 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  27.33 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  26.14 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  27.43 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  20 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  31.25 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.67 
 
 
234 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.43 
 
 
190 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  28.4 
 
 
231 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  25.49 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35 
 
 
254 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  32 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  24.81 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  25.64 
 
 
182 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.14 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  39.66 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  32.86 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  28.4 
 
 
229 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.7 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.33 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.33 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  35 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.81 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  32 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  23.73 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  27.5 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  42.31 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  22.54 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  25 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.31 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  40.98 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.06 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  21.62 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  33.33 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  33.85 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  21.62 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  42.59 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.2 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  34.55 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.78 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  29.37 
 
 
178 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.93 
 
 
189 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  26.67 
 
 
202 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  32.31 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.91 
 
 
214 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.23 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  35.62 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.65 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.74 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  26.79 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  21.33 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  31.88 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  26.67 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  26.36 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  32.79 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  25.71 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  27.68 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  30.36 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.43 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.37 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  22.22 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  37.74 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.18 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  29.51 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  25.71 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.43 
 
 
208 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>