More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0387 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  88.03 
 
 		 142 aa  257  5.0000000000000005e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  87.32 
 
 		 142 aa  255  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  86.52 
 
 		 147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  85.82 
 
 		 147 aa  251  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  86.52 
 
 		 141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  84.4 
 
 		 142 aa  245  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1597  50S ribosomal protein L13  78.01 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1909  ribosomal protein L13  77.94 
 
 		 142 aa  223  9e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0092  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.96 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  55.88 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  54.14 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  55.64 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  57.36 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  57.46 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  57.36 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0505  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 146 aa  154  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 144 aa  153  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  53.73 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  56.15 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  57.36 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  56.72 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0482  50S ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  57.36 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_447  ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000466788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  57.36 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  56.59 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  55.97 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  57.36 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  52.99 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  56.59 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>