More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1981 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1981  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1238  hypothetical protein  71.76 
 
 		 132 aa  192  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0851  hypothetical protein  64.12 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00201789  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1067  hypothetical protein  61.07 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0769  hypothetical protein  58.78 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1331  hypothetical protein  58.02 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0694  hypothetical protein  58.02 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0752  conserved hypothetical protein (UPF0079 domain protein)  54.89 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1024  protein of unknown function UPF0079  49.09 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1150  hypothetical protein  45.86 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.864213  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  36.52 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  31.69 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  39.58 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  35 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  32 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.56 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  34.19 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  32.28 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  39.42 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  37.61 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  38.53 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  31.54 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.97 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  37.78 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  34.88 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  33.59 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  33.87 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  31.25 
 
 		 505 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  33.9 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  41.77 
 
 		 503 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  38.27 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  40.51 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  40 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  33.93 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  36.67 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  31.5 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  27.97 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  33.87 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  36.67 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.44 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  32.14 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  32.67 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  36.36 
 
 		 509 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.86 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  33.05 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  34.86 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  32.32 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  37.62 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  36.7 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  32.67 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  28.93 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  34.26 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  35.4 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  40.22 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.79 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.26 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  32.26 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  29.32 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  31.18 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  34.23 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  32.82 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  33.91 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  31.19 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  28.7 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  44.32 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.8 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  29.92 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  36.14 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  37.93 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  31.96 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  35.78 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  36.96 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  34.86 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  36.9 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  34.34 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  38.04 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  36.67 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  40.62 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  34.91 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  35.59 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf806  hypothetical protein  38.1 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.27 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  37.21 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  37.21 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  35.48 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  31.07 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>