More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1231 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  100 
 
 
356 aa  738    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  63.48 
 
 
356 aa  482  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  54.93 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.43 
 
 
352 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.96 
 
 
361 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.7 
 
 
361 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  34.27 
 
 
370 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.22 
 
 
367 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  33.44 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.45 
 
 
367 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  31.58 
 
 
369 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  33 
 
 
389 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.58 
 
 
458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.52 
 
 
394 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  30.46 
 
 
356 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  31.56 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.2 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.9 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.9 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  29.46 
 
 
359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  30.25 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.25 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.25 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.25 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  30.25 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.9 
 
 
356 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.24 
 
 
356 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.95 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.04 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.57 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.04 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.04 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1800  LPS heptosyltransferase-like  30.81 
 
 
362 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597786 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
392 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
392 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
392 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.71 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.71 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
402 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
386 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.6 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32 
 
 
387 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.79 
 
 
361 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  28.52 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.33 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.33 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  27.86 
 
 
385 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.69 
 
 
350 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.72 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.8 
 
 
359 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.63 
 
 
368 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
364 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  27.36 
 
 
330 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
409 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.48 
 
 
339 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.6 
 
 
360 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.4 
 
 
516 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  25.62 
 
 
344 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  23.58 
 
 
779 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.58 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  27.6 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.74 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
347 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1407  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
306 aa  93.2  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  26.49 
 
 
342 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
324 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
378 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.19 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  25.68 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  25.68 
 
 
418 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.47 
 
 
352 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  25.68 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.05 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.47 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.47 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  23.73 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.24 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.21 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.08 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  27.78 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.25 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  24.66 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.25 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.36 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  23.25 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  23.25 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.55 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  25.5 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  25.36 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.18 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0510  glycosyl transferase family 9  26.62 
 
 
345 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>