More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1695 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1695  GacS/BarA family sensor protein  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  40.32 
 
 
691 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  42.86 
 
 
789 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.67 
 
 
1442 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  36.97 
 
 
847 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.83 
 
 
763 aa  98.6  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  42.02 
 
 
789 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1305 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  37.19 
 
 
641 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4809  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1202 aa  95.9  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3343  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
800 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.339102  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2133  hypothetical protein  43.44 
 
 
302 aa  95.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
1054 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.46 
 
 
778 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2108  hypothetical protein  42.62 
 
 
302 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.18 
 
 
778 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1029 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.18 
 
 
778 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.18 
 
 
778 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.18 
 
 
778 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.18 
 
 
778 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.34 
 
 
1023 aa  94.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
631 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  42.02 
 
 
779 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  39.34 
 
 
683 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  39.5 
 
 
630 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  39.5 
 
 
630 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  39.34 
 
 
669 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  38.33 
 
 
676 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1005 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
782 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
762 aa  93.2  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.5 
 
 
1346 aa  93.6  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  42.02 
 
 
779 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.77 
 
 
1014 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
967 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
899 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  39.17 
 
 
678 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
601 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
945 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  41.18 
 
 
777 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  40.5 
 
 
1021 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1363 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00947  Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
237 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000206574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.09 
 
 
784 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  36.59 
 
 
578 aa  90.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  39.84 
 
 
779 aa  90.5  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.89 
 
 
1177 aa  90.5  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
759 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1118 aa  90.1  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1055  sensor histidine kinase/response regulator  38.66 
 
 
514 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  39.5 
 
 
778 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  39.34 
 
 
955 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  39.5 
 
 
778 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  39.5 
 
 
778 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
916 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  37.5 
 
 
1060 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
833 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  36.67 
 
 
588 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  35.83 
 
 
590 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
984 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  36.29 
 
 
657 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0835  two component system histidine kinase  40.32 
 
 
831 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  39.67 
 
 
1055 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
947 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.44 
 
 
753 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  40.5 
 
 
797 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  36.29 
 
 
657 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
902 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
822 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1160  putative sensor protein gacS  40.32 
 
 
808 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.61 
 
 
1135 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
932 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 
1064 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
785 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
695 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  35.83 
 
 
977 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  34.15 
 
 
651 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1040 aa  88.2  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  37.3 
 
 
1351 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
830 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1059 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.84 
 
 
858 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  34.15 
 
 
651 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
946 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
717 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.1 
 
 
784 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
990 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
993 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1316 aa  87  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>