120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12428 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  882    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  64.33 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  46.9 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  46.8 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  47.59 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  35.36 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  33.41 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  31.34 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  31.91 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  32.25 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  33.26 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  32.8 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  29.78 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 469 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  28.67 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  30.11 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  33.26 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  33.26 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  33.26 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 439 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  33.26 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  33.26 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  33.26 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  30.23 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  30.96 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  31.16 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  30.73 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 572 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  26.42 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 419 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  26.65 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  23.74 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  24.56 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  26.59 
 
 		 435 aa  106  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  23.33 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  26.59 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 462 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  23.22 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 465 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 462 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 493 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  25.56 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  24.81 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 456 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  24.89 
 
 		 424 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  21.5 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  21.73 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  20.35 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00360  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>