More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11818 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  42.06 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  40.68 
 
 		 222 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  36.52 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  41.18 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  44 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.34 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.38 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  39.39 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  41.24 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  35.87 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  40.7 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 484 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 484 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  40.26 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  34.71 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  31.9 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  34.71 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.87 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  38.1 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  40 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  32.71 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  36.84 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.48 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.45 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  41.46 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  42.17 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  43.04 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  37.35 
 
 		 685 aa  65.1  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  32.22 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.06 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.38 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  34.78 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  34.74 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  36.59 
 
 		 598 aa  63.9  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  45.21 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  47.37 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  43.06 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  37.86 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.59 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.59 
 
 		 566 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  35.34 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  40.28 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  33.67 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  44.59 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  35.29 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  43.28 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 		 387 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>