More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10943 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  61.09 
 
 		 659 aa  856    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  100 
 
 		 668 aa  1386    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  58.75 
 
 		 659 aa  814    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  59.09 
 
 		 659 aa  825    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  51.68 
 
 		 657 aa  703    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  70.27 
 
 		 658 aa  974    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  35.38 
 
 		 675 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4204  transketolase central region  35.67 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  35.75 
 
 		 710 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  33.83 
 
 		 678 aa  333  5e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  33.13 
 
 		 669 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  32.7 
 
 		 702 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  32.07 
 
 		 736 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  46.32 
 
 		 343 aa  319  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  47.51 
 
 		 320 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  30.83 
 
 		 688 aa  299  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  46.13 
 
 		 327 aa  297  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  28.96 
 
 		 791 aa  296  9e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  29.09 
 
 		 823 aa  287  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  44.37 
 
 		 327 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.27 
 
 		 324 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  43.96 
 
 		 324 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.27 
 
 		 324 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  43.96 
 
 		 324 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  44.97 
 
 		 320 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  44.92 
 
 		 327 aa  280  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0746  Transketolase central region  45.45 
 
 		 321 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  44.59 
 
 		 327 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  43.22 
 
 		 336 aa  278  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  42.76 
 
 		 342 aa  277  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.78 
 
 		 327 aa  276  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  45.78 
 
 		 327 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  45.78 
 
 		 327 aa  276  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  45.78 
 
 		 327 aa  276  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.78 
 
 		 327 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.78 
 
 		 327 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  45.78 
 
 		 327 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.1 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  44.55 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  46.1 
 
 		 327 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  42.95 
 
 		 342 aa  275  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  45.78 
 
 		 327 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.78 
 
 		 327 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  43.75 
 
 		 326 aa  273  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  44.9 
 
 		 325 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2221  transketolase central region  44.9 
 
 		 325 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2234  Transketolase central region  44.9 
 
 		 325 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0388155  hitchhiker  0.0000275487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  44.48 
 
 		 327 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2200  transketolase central region  44.9 
 
 		 325 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.670418  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  44.9 
 
 		 325 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1787  transketolase, central region  46.13 
 
 		 325 aa  272  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  41.54 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1926  transketolase, central region  45.22 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  44.59 
 
 		 325 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  40.66 
 
 		 346 aa  270  7e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  31.21 
 
 		 666 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.16 
 
 		 325 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  43.83 
 
 		 327 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  44.27 
 
 		 325 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  44.27 
 
 		 325 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  44.27 
 
 		 325 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  41.67 
 
 		 327 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  42.81 
 
 		 322 aa  268  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  31.06 
 
 		 681 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  46.18 
 
 		 330 aa  267  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2245  transketolase central region  44.9 
 
 		 325 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.38248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  44.2 
 
 		 325 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  266  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  42.72 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  42.37 
 
 		 320 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1936  transketolase, central region  44.19 
 
 		 325 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208007  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  29.09 
 
 		 692 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  41.8 
 
 		 328 aa  264  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  29.55 
 
 		 692 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  41.35 
 
 		 325 aa  262  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  41.98 
 
 		 325 aa  263  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  41.98 
 
 		 325 aa  263  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  44.51 
 
 		 325 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  44.74 
 
 		 331 aa  261  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  43.31 
 
 		 325 aa  261  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  40.13 
 
 		 327 aa  261  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2279  transketolase central region  42.99 
 
 		 325 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0946351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  40 
 
 		 327 aa  260  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  43.63 
 
 		 325 aa  260  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  40 
 
 		 327 aa  260  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.63 
 
 		 325 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  40.77 
 
 		 337 aa  259  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  41.38 
 
 		 327 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  41.38 
 
 		 327 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  42.24 
 
 		 337 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  40.77 
 
 		 337 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  40.06 
 
 		 324 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  43.63 
 
 		 325 aa  259  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>