128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0962 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  335  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  47.97 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  49.31 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  54.01 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  46.85 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  45.27 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  43.92 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  43.92 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  39.87 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  41.67 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  46.76 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  47.41 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  39.13 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  37.5 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  43.7 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.92 
 
 		 137 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  38.17 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.6 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  38.17 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.8 
 
 		 138 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  35.88 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  35.48 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.13 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.85 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  29.13 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.74 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.74 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.74 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.74 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.74 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.74 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.04 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  30.53 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 667 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  32.76 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 		 779 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  23.66 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  23.66 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  22.56 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 926 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 927 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  23.66 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  28.95 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  25.58 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  24.43 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  23.66 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 133 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25.4 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  25.98 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  21.77 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.72 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.14 
 
 		 941 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  21.8 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  20.69 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  22.73 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  24.82 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  23.7 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  20.34 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  25.95 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  26.77 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  22.05 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  25.95 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  24.18 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  25.36 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  24.09 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  26.05 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1768  hemerythrin-like metal-binding protein  20.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  29.9 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  29.9 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  26.4 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  25.17 
 
 		 736 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.63 
 
 		 722 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  24.03 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  24.41 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.78 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.76 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  23.4 
 
 		 360 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  26.76 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  25.6 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  23.97 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  21.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2454  cyclic nucleotide-binding protein  30.99 
 
 		 871 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  27.12 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  23.88 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  22.79 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.61 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  25 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  18.55 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  24.6 
 
 		 529 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  18.97 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  18.55 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  23.64 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  26.06 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  22.9 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  23.26 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>