More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0838 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
383 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
383 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  63.66 
 
 
379 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.44 
 
 
383 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  43.9 
 
 
382 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.19 
 
 
384 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  42.2 
 
 
379 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  42.2 
 
 
379 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.32 
 
 
539 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  40.46 
 
 
383 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 
326 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  39.1 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  40.59 
 
 
389 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.73 
 
 
386 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.22 
 
 
366 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  41.08 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  41.4 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.45 
 
 
288 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.09 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  29.69 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.69 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  32.17 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2242  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.68 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000922808  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.81 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.08 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  29.77 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27520  transposase  28.57 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0618787  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27550  transposase  28.57 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.71 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  27.61 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  29.32 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.73 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  29.32 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.47 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.18 
 
 
311 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  27.3 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.98 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.98 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  27.27 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.19 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.19 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  26.15 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.79 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.79 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.79 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.37 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.25 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.37 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.31 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.37 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.65 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.46 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  23.88 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.3 
 
 
344 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2661  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.24 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0894966  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.04 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3945  IS110 family transposase  32.07 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4548  IS110 family transposase  32.07 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0768  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  30.53 
 
 
284 aa  64.7  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.76 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.84 
 
 
499 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2197  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1848  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1983  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0555  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1033  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0636  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.596694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1826  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1839  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0847  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2209  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0854  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00143492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1976  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0007  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0124  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0330  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000188022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0155  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.239351  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0668  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1835  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1952  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.707191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1231  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1568  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0135752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1406  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1591  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000798859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1676  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1529  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1256  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0733  transposase for insertion sequence element IS1111A  26.85 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>