165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2680 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  100 
 
 		 647 aa  1331    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  42.8 
 
 		 708 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  37.92 
 
 		 779 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  37.5 
 
 		 798 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  37.17 
 
 		 798 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  37.77 
 
 		 799 aa  353  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  36.69 
 
 		 779 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  35.15 
 
 		 872 aa  349  8e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  31.62 
 
 		 698 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  30.66 
 
 		 620 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  30.04 
 
 		 706 aa  231  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  31.46 
 
 		 625 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  32.02 
 
 		 523 aa  210  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  31.52 
 
 		 647 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  34.3 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  29.02 
 
 		 661 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  26.61 
 
 		 840 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.79 
 
 		 1094 aa  197  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  26.96 
 
 		 687 aa  193  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  32.76 
 
 		 631 aa  191  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  28.04 
 
 		 643 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  29.07 
 
 		 677 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  29.39 
 
 		 628 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.99 
 
 		 536 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  29.53 
 
 		 676 aa  157  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  25.43 
 
 		 734 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  31.44 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  29.9 
 
 		 679 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.54 
 
 		 515 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  31.96 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  27.36 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  27.67 
 
 		 528 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.55 
 
 		 487 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  25.95 
 
 		 547 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  26.08 
 
 		 527 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  26.48 
 
 		 490 aa  111  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.61 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.22 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.99 
 
 		 569 aa  109  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  35.59 
 
 		 516 aa  104  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  26.26 
 
 		 534 aa  102  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  35.62 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  35.62 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  26.01 
 
 		 534 aa  100  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.16 
 
 		 1380 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  27.05 
 
 		 533 aa  97.8  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  25.06 
 
 		 506 aa  97.4  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  21.72 
 
 		 551 aa  94.7  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  31.33 
 
 		 570 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  26.41 
 
 		 1973 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  27.02 
 
 		 877 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  26.49 
 
 		 504 aa  89.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  25.24 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  26.04 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  25.83 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  26.3 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  26.3 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  26.3 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  26.3 
 
 		 529 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  26.3 
 
 		 529 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  26.3 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  26.61 
 
 		 519 aa  87.8  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  25.83 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  26.33 
 
 		 1430 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  26.3 
 
 		 529 aa  87.8  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  29.23 
 
 		 760 aa  87.8  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  32.29 
 
 		 1299 aa  87.4  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  28.46 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  33.67 
 
 		 1601 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  34.2 
 
 		 1303 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  27.05 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  29.28 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  27.46 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  24.87 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  24.81 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  25.31 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1131 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  24.02 
 
 		 1131 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  24.06 
 
 		 1131 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  24.67 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  27.66 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  27.66 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  27.44 
 
 		 536 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  27.44 
 
 		 536 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  27.84 
 
 		 536 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  31.84 
 
 		 1299 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.94 
 
 		 1201 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  28.51 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  23.86 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  28.51 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  34.91 
 
 		 1363 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 586 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  24.6 
 
 		 539 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  34.91 
 
 		 1363 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  28.39 
 
 		 533 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  26.14 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  25.3 
 
 		 895 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>