More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2536 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2536  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481736 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5388  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5102  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  30.67 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1784  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  29.88 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4168  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.399858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4119  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4046  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4699  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254912  normal  0.0113206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.95 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.35 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  30.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4404  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.3 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 321 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  27.3 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4814  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3737  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5965  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0576334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2126  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.11 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  28.11 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2806  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  25.72 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6811  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0162  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>