More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1398 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1398  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 539 aa  1075    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00538368  normal  0.128237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  66.42 
 
 		 541 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5197  ABC transporter related  90.91 
 
 		 540 aa  990    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.26 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.31 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.25 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.19 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 		 498 aa  363  6e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.48 
 
 		 497 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  39.73 
 
 		 502 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 492 aa  360  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.86 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  38.36 
 
 		 513 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.28 
 
 		 508 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  42.12 
 
 		 511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  41.98 
 
 		 503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  41.8 
 
 		 585 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38 
 
 		 501 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  41 
 
 		 504 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  38.3 
 
 		 505 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  40.97 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.19 
 
 		 508 aa  353  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.46 
 
 		 512 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.46 
 
 		 512 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  41.13 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.89 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  35.51 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.07 
 
 		 492 aa  352  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  39.92 
 
 		 497 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.08 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.15 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.47 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.38 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  40.38 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.38 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.78 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  39.15 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.31 
 
 		 503 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.97 
 
 		 512 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.52 
 
 		 495 aa  349  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.27 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.66 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  38.55 
 
 		 503 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.19 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 504 aa  348  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  39.49 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.07 
 
 		 513 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  41.26 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 		 494 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.06 
 
 		 501 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  40.59 
 
 		 513 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  35.77 
 
 		 500 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.65 
 
 		 500 aa  345  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  39.88 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  39.43 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.92 
 
 		 505 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  36.35 
 
 		 509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.65 
 
 		 522 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.39 
 
 		 514 aa  343  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  39.48 
 
 		 514 aa  343  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  40.68 
 
 		 509 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 505 aa  343  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 515 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  36.28 
 
 		 520 aa  342  7e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  36.89 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  41.3 
 
 		 493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  37.02 
 
 		 537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  38.84 
 
 		 517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.96 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.18 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.98 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 		 508 aa  340  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 		 523 aa  340  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.44 
 
 		 516 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  39.3 
 
 		 504 aa  339  7e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 519 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.68 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  38.65 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  41.17 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 506 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 		 515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 		 515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 528 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  38.77 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  35.88 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>