More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0534 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  89.96 
 
 		 272 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  73.96 
 
 		 267 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  70.68 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  68.7 
 
 		 270 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  71.76 
 
 		 271 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  66.67 
 
 		 270 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  66.28 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  68.56 
 
 		 270 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  69.11 
 
 		 269 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  69.11 
 
 		 269 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  68.94 
 
 		 270 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  68.94 
 
 		 270 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  68.32 
 
 		 270 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  44.63 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  48 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  46 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  38.4 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 425 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 226 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  32.23 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  32.23 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.39 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  29.82 
 
 		 219 aa  98.6  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.94 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.13 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  28.47 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.74 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.74 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  28.52 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 326 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  30.52 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.23 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  25.9 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.97 
 
 		 367 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.17 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  25.9 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.55 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  29.81 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  24.91 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  27.41 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  26.3 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  26.3 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.62 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.52 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  26.3 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  26.3 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>