More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4451 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  100 
 
 		 438 aa  874    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 437 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  40.05 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 436 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 437 aa  276  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 429 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 429 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  35.58 
 
 		 447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 430 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 450 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  38.66 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  36.97 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  38.01 
 
 		 447 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 447 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 441 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  37.77 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.61 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 412 aa  134  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 407 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  32.01 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 425 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  30.18 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.41 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.41 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.11 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  29.4 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.87 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  28.53 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  27.39 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  29.77 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.62 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.87 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  28.76 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.26 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 467 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  26.62 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.37 
 
 		 402 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.37 
 
 		 402 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  28.32 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 421 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>