48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2282 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  80.65 
 
 		 94 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  65.85 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  42.11 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  38.96 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  43.94 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  37.8 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  38.6 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 125 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 197 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 276 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1443  hypothetical protein  45.1 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>