More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4212 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  91.08 
 
 
157 aa  300  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  88.31 
 
 
188 aa  283  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  88.96 
 
 
161 aa  283  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  88.96 
 
 
161 aa  283  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  82.58 
 
 
160 aa  274  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  79.87 
 
 
160 aa  259  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  60 
 
 
162 aa  196  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 
164 aa  191  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 
163 aa  190  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  57.86 
 
 
165 aa  184  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  55.97 
 
 
165 aa  181  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  56.36 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  56.36 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  56.36 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
168 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
222 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
222 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
174 aa  177  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
168 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  55.76 
 
 
171 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
171 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  55.76 
 
 
171 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
171 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
171 aa  176  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
174 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
171 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  55.15 
 
 
218 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  53.61 
 
 
171 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 
161 aa  142  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
181 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.95 
 
 
154 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
153 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  44.52 
 
 
158 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  48.7 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44.16 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  47.4 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  47.74 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  42.21 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  47.13 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  47.13 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  47.13 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.51 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
157 aa  127  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.04 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  43.87 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  46.45 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>