More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2930 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2930  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  609  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2072  LysR family transcriptional regulator  69.36 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30990  Transcriptional regulator LysR family protein  64.72 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02290  LysR family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 311 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1510  LysR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451093  normal  0.28121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0261  putative transcriptional regulator  58.03 
 
 		 310 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5034  transcriptional regulator, LysR family  58.36 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3875  putative transcriptional regulator  56.21 
 
 		 307 aa  341  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656109  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3487  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  56.54 
 
 		 307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5381  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.5816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1853  LysR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0383468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3859  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1429  LysR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1754  LysR family transcriptional regulator  52.96 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1464  LysR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4436  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 305 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0526  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0720  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0600  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6102  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0887  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2748  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 349 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0634  transcription regulator protein  36.21 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31630  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.469253  normal  0.129426 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000041163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>