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for query gene Bphyt_2125 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 537 aa  1065    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  76.12 
 
 		 535 aa  776    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  73.38 
 
 		 541 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  98.4 
 
 		 499 aa  980    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  59.96 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  55.43 
 
 		 544 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  56.53 
 
 		 513 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  55.51 
 
 		 530 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  56.53 
 
 		 513 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  56.57 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  56.12 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  52.76 
 
 		 509 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  51.46 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  50.49 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 545 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  48.02 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.17 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 509 aa  346  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 522 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  40.22 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  40.45 
 
 		 498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.55 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  29.84 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  29.98 
 
 		 499 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  30.46 
 
 		 545 aa  204  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.28 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 516 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 516 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.21 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 		 540 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 		 536 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 527 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.42 
 
 		 539 aa  187  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  27.33 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.9 
 
 		 535 aa  183  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 535 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.01 
 
 		 539 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 		 526 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.75 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 542 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.64 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.62 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.36 
 
 		 543 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 526 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.08 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.41 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.44 
 
 		 519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.08 
 
 		 514 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.05 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  24.95 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  27.2 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  27.1 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.93 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 		 539 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 		 521 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.45 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  26.28 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 519 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.71 
 
 		 526 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 515 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 		 517 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.95 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.21 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  26.54 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.74 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.34 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.13 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.35 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 		 520 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  26.55 
 
 		 519 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
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NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 523 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4583  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 519 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169299  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.83 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5722  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 519 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102537  normal  0.245407 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.83 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 519 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196393  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.83 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
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