70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1538 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  61.81 
 
 		 641 aa  782    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  65.69 
 
 		 629 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  63.36 
 
 		 638 aa  816    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  65.69 
 
 		 626 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  63.88 
 
 		 634 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  65.52 
 
 		 626 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  65.52 
 
 		 634 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  65.69 
 
 		 626 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  65.69 
 
 		 632 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  90.6 
 
 		 639 aa  1179    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  63.36 
 
 		 638 aa  815    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  63.97 
 
 		 634 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  71.38 
 
 		 632 aa  929    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  66.27 
 
 		 665 aa  765    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  64.09 
 
 		 635 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  100 
 
 		 637 aa  1299    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  65.24 
 
 		 588 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  47.8 
 
 		 633 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  46.96 
 
 		 633 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  35.89 
 
 		 616 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  27.89 
 
 		 647 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  29.98 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  28.74 
 
 		 637 aa  193  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  28.74 
 
 		 637 aa  193  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  26.48 
 
 		 636 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  26.48 
 
 		 636 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  31.52 
 
 		 342 aa  157  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  28.07 
 
 		 621 aa  110  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  28.07 
 
 		 621 aa  110  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 1256 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 		 1256 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1338 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  23.93 
 
 		 613 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  23.93 
 
 		 613 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  25.21 
 
 		 1256 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1096 aa  91.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  22.56 
 
 		 647 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  22.56 
 
 		 647 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1433 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  27.42 
 
 		 1431 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.16 
 
 		 1225 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1433 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 1253 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  23.68 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  21.33 
 
 		 642 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  28.65 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  25.87 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  21.51 
 
 		 673 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  23.13 
 
 		 753 aa  67  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  21.88 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  27.21 
 
 		 624 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  30.54 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  25.8 
 
 		 624 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  22.68 
 
 		 672 aa  60.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.09 
 
 		 1257 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  22.6 
 
 		 667 aa  60.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0530  tetratricopeptide TPR_4  29.07 
 
 		 1379 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  25.8 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  24.77 
 
 		 856 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1042 aa  57  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1028 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  21.33 
 
 		 664 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  29.24 
 
 		 636 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  36.76 
 
 		 672 aa  54.7  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  23.81 
 
 		 621 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  37.18 
 
 		 684 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  31.17 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1239 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 		 438 aa  43.9  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>