40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7193 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  100 
 
 		 409 aa  825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  59.8 
 
 		 410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  58.39 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  59.18 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  56.34 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  56.96 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  55.85 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  55.85 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  29.37 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 146 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  44 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  36.36 
 
 		 678 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  35.58 
 
 		 131 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  36.7 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  35.16 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  30.5 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  29.37 
 
 		 171 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  25.32 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  27.83 
 
 		 181 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  34.91 
 
 		 179 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  30.47 
 
 		 200 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  32.69 
 
 		 180 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  35.9 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1740  hypothetical protein  27.98 
 
 		 262 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1948  cytochrome cM  35.06 
 
 		 137 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.17 
 
 		 749 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  29.13 
 
 		 200 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  30.43 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  34.62 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  28.16 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  32.74 
 
 		 708 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  26.72 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 139 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  28.28 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  30 
 
 		 186 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  29.81 
 
 		 194 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 194 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0469  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 250 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.989783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  60 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>