43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6909 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6909  amidohydrolase 2  100 
 
 		 266 aa  534  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  29.86 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  26.87 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.56 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.89 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.05 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  28.12 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  29.12 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  24 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  25.18 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  23.5 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 301 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2903  amidohydrolase 2  28.16 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.844973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  22.12 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.69 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.46 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0865  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  26.57 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2828  amidohydrolase 2  23.9 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  27.03 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25.7 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  28.64 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 308 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>