More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5919 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  75.83 
 
 
302 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  70.67 
 
 
302 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  67.55 
 
 
298 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  62.46 
 
 
296 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.93 
 
 
305 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  49.33 
 
 
301 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.33 
 
 
299 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  49.5 
 
 
311 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  48 
 
 
306 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  49.17 
 
 
311 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  48.33 
 
 
306 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  46 
 
 
299 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  49.17 
 
 
316 aa  289  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.84 
 
 
297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 
297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  46.51 
 
 
299 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  45.85 
 
 
302 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  47.35 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  47.51 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  48.17 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  45.85 
 
 
301 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  46.05 
 
 
301 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  45.18 
 
 
301 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
301 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  43.65 
 
 
302 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  44.22 
 
 
298 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  42.38 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  42.38 
 
 
298 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  42.38 
 
 
298 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  42.48 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  42.19 
 
 
302 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
478 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
474 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  29.8 
 
 
553 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
500 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 
611 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  31.02 
 
 
469 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
487 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
456 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
459 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.45 
 
 
659 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1408  amidophosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  28.34 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  29.48 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.4 
 
 
611 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
609 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  31.11 
 
 
608 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
609 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
494 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
494 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
599 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14994  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase  34.72 
 
 
606 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.14 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  23.77 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1342  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  31.46 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.2 
 
 
602 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0953  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.88 
 
 
599 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.590452  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 
612 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.9 
 
 
611 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
609 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0428  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3049  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.17 
 
 
604 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.749851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1000  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
602 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  27.06 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  40.66 
 
 
609 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
609 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  33.15 
 
 
606 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.47 
 
 
610 aa  70.1  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.59 
 
 
604 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.59 
 
 
604 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
485 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  33.09 
 
 
611 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0103  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.54 
 
 
609 aa  69.3  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>