More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1408 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1359  amidophosphoribosyltransferase  68.9 
 
 
454 aa  656    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0189  amidophosphoribosyltransferase  84.53 
 
 
445 aa  780    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0845  amidophosphoribosyltransferase  70.63 
 
 
445 aa  653    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1137  amidophosphoribosyltransferase  70.63 
 
 
445 aa  674    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1408  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
446 aa  913    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  71.3 
 
 
446 aa  677    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0206  amidophosphoribosyltransferase  84.08 
 
 
445 aa  776    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0227  amidophosphoribosyltransferase  84.53 
 
 
445 aa  779    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  66.59 
 
 
445 aa  630  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  54.61 
 
 
451 aa  503  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  48.65 
 
 
467 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
466 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
477 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  48.32 
 
 
474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  48.32 
 
 
477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
468 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
474 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
462 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
471 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
500 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
491 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
491 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  46.62 
 
 
475 aa  431  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  46.64 
 
 
487 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
491 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  48.32 
 
 
471 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  48.66 
 
 
471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
466 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
491 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
488 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  46.62 
 
 
481 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
486 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  48.66 
 
 
471 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  47.07 
 
 
469 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
478 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  45.72 
 
 
461 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
514 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  48.44 
 
 
471 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
476 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
503 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
517 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
500 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
493 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  47.78 
 
 
471 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  46.1 
 
 
495 aa  421  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  46.74 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  48.11 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
496 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
462 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
472 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
473 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
493 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  44.87 
 
 
503 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  45.49 
 
 
461 aa  409  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
484 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
485 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
485 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
514 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
470 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
473 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
509 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  44.27 
 
 
499 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
480 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
485 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  45.64 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  46.33 
 
 
491 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
529 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
459 aa  403  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  44.99 
 
 
502 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 
470 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
479 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0655  amidophosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  45.43 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  44.7 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  46 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  43.15 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
472 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
487 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  44.32 
 
 
500 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  46.33 
 
 
510 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
503 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
472 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  44.99 
 
 
494 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
482 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  44.99 
 
 
494 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
480 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>