62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5634 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.12 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  39.33 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  39.33 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  39.33 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  40.58 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5270  putative XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  41.03 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4902  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173853  normal  0.0865423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  34.57 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.63 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  37.5 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  37.5 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  37.5 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  37.5 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  37.5 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3754  helix-turn-helix domain protein  43.06 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  37.5 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  34.29 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.81 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.81 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  32.81 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.81 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  32.81 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  35.71 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  31.75 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  40 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0404  XRE family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 825 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2846  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 443 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.675443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>