236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3293 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  79.39 
 
 		 551 aa  854    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  69.2 
 
 		 545 aa  756    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  77.86 
 
 		 551 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  79.39 
 
 		 551 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  77.68 
 
 		 551 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  77.13 
 
 		 551 aa  854    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  77.86 
 
 		 551 aa  870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  77.86 
 
 		 551 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  64.86 
 
 		 546 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  56.39 
 
 		 560 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  77.5 
 
 		 551 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  78.04 
 
 		 551 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  77.13 
 
 		 551 aa  860    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 555 aa  1118    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  77.86 
 
 		 551 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  79.39 
 
 		 551 aa  854    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  79.39 
 
 		 551 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  79.2 
 
 		 551 aa  852    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  79.39 
 
 		 551 aa  854    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  79.39 
 
 		 551 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  59.2 
 
 		 559 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  54.31 
 
 		 562 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  48.2 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  47.89 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  46.85 
 
 		 594 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  46.26 
 
 		 594 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  46.4 
 
 		 594 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  38.45 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  28.71 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  28.21 
 
 		 500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  28.33 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  21.34 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  25.13 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  30.2 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  22.63 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  21.98 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  22.66 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 516 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4411  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  22.1 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.9 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  24.57 
 
 		 465 aa  56.2  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 503 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 476 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 538 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  23.96 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 537 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 495 aa  54.3  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  22.89 
 
 		 533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  27.17 
 
 		 480 aa  54.3  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 482 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  22.89 
 
 		 533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  22.89 
 
 		 533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  22.89 
 
 		 533 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  21.43 
 
 		 467 aa  53.9  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  23.24 
 
 		 483 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.28 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  23.44 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3137  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 663 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0382789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  25.48 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  22.32 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  23.44 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  23.44 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 647 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  24.45 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.24 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.78 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  24.9 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  23.26 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  23.02 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  27.41 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  22 
 
 		 533 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>