More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3189 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  358  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  42.67 
 
 
174 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
175 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.89 
 
 
374 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  39.13 
 
 
172 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
228 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
226 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  41.89 
 
 
226 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  38.96 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  40.27 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  39.31 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  39.57 
 
 
185 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  36.91 
 
 
162 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.75 
 
 
189 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 
170 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  36.91 
 
 
168 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  34.67 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.42 
 
 
157 aa  97.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6858  flavin reductase-like, FMN-binding  37.82 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.34 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  36.48 
 
 
183 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  31.55 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  34.78 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.89 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  33.97 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.76 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.55 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  37.04 
 
 
175 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
155 aa  90.9  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.74 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
156 aa  90.9  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  32.72 
 
 
193 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
408 aa  88.6  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.84 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  35.19 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
167 aa  87.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2949  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.93 
 
 
201 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.53 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.67 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  33.55 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.39 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.12 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  31.41 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.87 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.24 
 
 
181 aa  84.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.23 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  33.12 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  30.32 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  33.09 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  32.89 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  36.72 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.03 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  30 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  34.44 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.48 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  31.87 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.64 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  29.49 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.13 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  29.81 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  32.93 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  32 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  31.41 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  30.67 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  35.1 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0202  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635021  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  30.77 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.33 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  31.4 
 
 
430 aa  77.4  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.33 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.43 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  29.5 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  30.77 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  33.79 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  33.33 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  34.09 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  31.71 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  32.08 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  31.06 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.92 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>