More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2759 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2952  histidinol dehydrogenase  81.09 
 
 
442 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3229  histidinol dehydrogenase  82.38 
 
 
442 aa  706    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2714  histidinol dehydrogenase  90.68 
 
 
445 aa  788    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3111  histidinol dehydrogenase  81.51 
 
 
445 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0429774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3693  histidinol dehydrogenase  90.68 
 
 
445 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3523  histidinol dehydrogenase  87.21 
 
 
438 aa  762    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2759  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
440 aa  895    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2993  histidinol dehydrogenase  90.23 
 
 
445 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.816536  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0106  Histidinol dehydrogenase  69.18 
 
 
440 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0352  histidinol dehydrogenase  87.9 
 
 
438 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0398  histidinol dehydrogenase  93.18 
 
 
440 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3239  histidinol dehydrogenase  90.68 
 
 
445 aa  788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2765  histidinol dehydrogenase  90.68 
 
 
445 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2882  histidinol dehydrogenase  82.38 
 
 
442 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.05844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3248  histidinol dehydrogenase  80.96 
 
 
444 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2682  histidinol dehydrogenase  88.79 
 
 
438 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0328  histidinol dehydrogenase  89.02 
 
 
438 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921041  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3666  histidinol dehydrogenase  90.68 
 
 
445 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0343  histidinol dehydrogenase  88.13 
 
 
438 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0404  histidinol dehydrogenase  88.79 
 
 
438 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3560  histidinol dehydrogenase  91.82 
 
 
440 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95048  hitchhiker  0.0000626576 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0425  histidinol dehydrogenase  88.79 
 
 
438 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  70.64 
 
 
440 aa  641    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1788  histidinol dehydrogenase  90.68 
 
 
445 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3724  histidinol dehydrogenase  90.68 
 
 
445 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3387  histidinol dehydrogenase  69.95 
 
 
433 aa  632  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1587  histidinol dehydrogenase  71.56 
 
 
438 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2946  histidinol dehydrogenase  72.73 
 
 
447 aa  616  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  68.74 
 
 
432 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  70.53 
 
 
439 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  71.63 
 
 
439 aa  611  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  70.53 
 
 
439 aa  610  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1165  histidinol dehydrogenase  70.7 
 
 
440 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0819  histidinol dehydrogenase  66.97 
 
 
440 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0804  histidinol dehydrogenase  70.07 
 
 
447 aa  591  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0696  histidinol dehydrogenase  71.43 
 
 
447 aa  591  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5524  histidinol dehydrogenase  71.03 
 
 
438 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  66.97 
 
 
436 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0831  histidinol dehydrogenase  68.42 
 
 
447 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.685549  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5020  histidinol dehydrogenase  66.44 
 
 
440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57780  histidinol dehydrogenase  66.67 
 
 
440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0900  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 
435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  64.76 
 
 
434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  65.52 
 
 
436 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  64.45 
 
 
441 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  65.06 
 
 
441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4438  histidinol dehydrogenase  64.52 
 
 
448 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4133  histidinol dehydrogenase  64.52 
 
 
448 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.823119  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  64.22 
 
 
441 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  64.22 
 
 
441 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4249  histidinol dehydrogenase  64.22 
 
 
441 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2406  histidinol dehydrogenase  63.76 
 
 
436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.411325  normal  0.080622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0745  histidinol dehydrogenase  67.67 
 
 
432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2212  histidinol dehydrogenase  65.52 
 
 
438 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  64.45 
 
 
438 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  62.3 
 
 
433 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0378  histidinol dehydrogenase  65.74 
 
 
434 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.195282  normal  0.400901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1713  histidinol dehydrogenase  68.65 
 
 
434 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.665039  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0989  histidinol dehydrogenase  60.78 
 
 
433 aa  542  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2112  histidinol dehydrogenase  62.36 
 
 
439 aa  531  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  61.33 
 
 
436 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0767  histidinol dehydrogenase  60.92 
 
 
433 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3168  histidinol dehydrogenase  59.77 
 
 
435 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  59.63 
 
 
433 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  59.63 
 
 
433 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0503  histidinol dehydrogenase  56.81 
 
 
430 aa  471  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2192  histidinol dehydrogenase  56.42 
 
 
432 aa  473  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.849117  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1902  histidinol dehydrogenase  55.86 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000519467  normal  0.0351537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  52.07 
 
 
437 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  52.4 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  53.33 
 
 
431 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  53.21 
 
 
436 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  54.63 
 
 
430 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  53.15 
 
 
434 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  53.15 
 
 
434 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  52.68 
 
 
434 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  53.23 
 
 
429 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  51.62 
 
 
445 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
432 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  55.53 
 
 
434 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  51.52 
 
 
436 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  52.66 
 
 
429 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  52.76 
 
 
429 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  53.62 
 
 
428 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  51.86 
 
 
434 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2140  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
437 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  54.46 
 
 
438 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  48.26 
 
 
430 aa  411  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  50.11 
 
 
434 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  51.03 
 
 
431 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  53.73 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  50.69 
 
 
431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  51.16 
 
 
447 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2883  histidinol dehydrogenase  49.42 
 
 
439 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0674081  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  49.07 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  48.47 
 
 
426 aa  401  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  47.81 
 
 
430 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  46.81 
 
 
430 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  47.58 
 
 
430 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>