More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2469 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
380 aa  780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  83.33 
 
 
398 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  83.86 
 
 
380 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  44.03 
 
 
381 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
389 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
386 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
376 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  31.42 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  30.36 
 
 
389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
351 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  40.41 
 
 
417 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
414 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5501  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205399  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
446 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
402 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
377 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
408 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  40.98 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
347 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2420  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
400 aa  86.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
415 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  37.75 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
340 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
414 aa  86.3  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
871 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  33.54 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  37.5 
 
 
377 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  28.42 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.39 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  32.89 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
819 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  35.76 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.77 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.12 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.28 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  38.69 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>