33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2735 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2735  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
453 aa  928    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00105552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  21.24 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
767 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
565 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
302 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
2262 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
468 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
713 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
1121 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
402 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  28.57 
 
 
1006 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.37 
 
 
668 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.15 
 
 
681 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
1297 aa  47  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
404 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  28.57 
 
 
1930 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 
890 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.58 
 
 
561 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
2262 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.47 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
750 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
917 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
589 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.76 
 
 
586 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.09 
 
 
561 aa  43.9  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 
206 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
480 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
718 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
421 aa  43.5  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>