More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0586 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
544 aa  1108    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  56.03 
 
 
534 aa  634  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  48.88 
 
 
535 aa  532  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  49.11 
 
 
534 aa  521  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  48.33 
 
 
542 aa  514  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  50.19 
 
 
534 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  48.61 
 
 
530 aa  480  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  46.58 
 
 
534 aa  477  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  44.42 
 
 
537 aa  449  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  42.62 
 
 
531 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  42.49 
 
 
533 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  44.01 
 
 
541 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  42.54 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  42.24 
 
 
538 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  39.59 
 
 
538 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  44.95 
 
 
535 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  42.03 
 
 
535 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  40.14 
 
 
552 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  37.52 
 
 
535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  35 
 
 
541 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  33.45 
 
 
545 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
550 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  34.46 
 
 
537 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  34.46 
 
 
537 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  34.46 
 
 
537 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  34.46 
 
 
537 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  34.46 
 
 
537 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  34.46 
 
 
537 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 
537 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  34.27 
 
 
537 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  35.02 
 
 
537 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  35.22 
 
 
537 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  35.02 
 
 
537 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  35.02 
 
 
537 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  35.22 
 
 
537 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  34.27 
 
 
537 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 
536 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 
545 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.79 
 
 
545 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  33.79 
 
 
525 aa  289  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
533 aa  289  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.46 
 
 
536 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 
544 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.27 
 
 
536 aa  287  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.46 
 
 
536 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.27 
 
 
536 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.06 
 
 
543 aa  286  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  33.68 
 
 
558 aa  286  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  33.88 
 
 
544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  36.47 
 
 
526 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  34.73 
 
 
536 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
538 aa  284  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  32.68 
 
 
547 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.08 
 
 
536 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.08 
 
 
536 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  35.94 
 
 
526 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 
547 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  33.81 
 
 
538 aa  280  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.89 
 
 
536 aa  279  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 
533 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 
544 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  35.77 
 
 
530 aa  278  2e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  33.67 
 
 
560 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 
543 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.14 
 
 
543 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.81 
 
 
543 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.81 
 
 
543 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  32.67 
 
 
537 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  30.88 
 
 
556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.81 
 
 
543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  34.5 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 
539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 
549 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 
538 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 
556 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 
536 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 
543 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.32 
 
 
550 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
533 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  32.64 
 
 
543 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.64 
 
 
558 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  32.64 
 
 
543 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
558 aa  270  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.64 
 
 
543 aa  270  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.64 
 
 
543 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
542 aa  270  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.64 
 
 
558 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
538 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 
538 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  33.4 
 
 
538 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.64 
 
 
558 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  32.51 
 
 
555 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.4 
 
 
543 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  33.4 
 
 
538 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  32.34 
 
 
530 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 
528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  31.47 
 
 
537 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>