More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2500 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  100 
 
 		 577 aa  1156    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  67.28 
 
 		 545 aa  768    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  57.25 
 
 		 553 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  48.59 
 
 		 530 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 544 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 511 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 513 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  47.08 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  43.59 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 541 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 535 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.24 
 
 		 524 aa  351  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 509 aa  309  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  38.37 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 522 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  37.56 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.72 
 
 		 527 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.6 
 
 		 529 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  28.86 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.2 
 
 		 539 aa  193  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.81 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  27.33 
 
 		 519 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 		 516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  27.04 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 523 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.24 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 		 516 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 		 517 aa  177  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.67 
 
 		 535 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.07 
 
 		 539 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.47 
 
 		 543 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.46 
 
 		 526 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  25.57 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.41 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.06 
 
 		 540 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.91 
 
 		 538 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.03 
 
 		 529 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  23.39 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.27 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.75 
 
 		 542 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.75 
 
 		 542 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.59 
 
 		 542 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.4 
 
 		 542 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.76 
 
 		 527 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  25.34 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.81 
 
 		 504 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.58 
 
 		 514 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  25.46 
 
 		 503 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 528 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 528 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 528 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0954  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.05 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.21 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.05 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  24.47 
 
 		 528 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.32 
 
 		 527 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.43 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  24.9 
 
 		 511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  23.52 
 
 		 508 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.55 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.65 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.33 
 
 		 531 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.29 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.41 
 
 		 526 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.39 
 
 		 523 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.09 
 
 		 526 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.69 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.1 
 
 		 524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.1 
 
 		 524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
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NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.54 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.12 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.33 
 
 		 521 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.33 
 
 		 523 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.68 
 
 		 530 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.09 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.49 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  23.92 
 
 		 523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.32 
 
 		 524 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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