77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0849 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  234  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  93.81 
 
 		 113 aa  217  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0857  PadR family transcriptional regulator  92.92 
 
 		 113 aa  216  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0432305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0947  PadR family transcriptional regulator  92.04 
 
 		 113 aa  215  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0891  PadR family transcriptional regulator  92.04 
 
 		 113 aa  215  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0845  transcriptional regulator  92.92 
 
 		 113 aa  216  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1118  transcriptional regulator, PadR family  91.15 
 
 		 113 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  47.06 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1722  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  26.04 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0258  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.630662  normal  0.0600002 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35.53 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  32.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3915  PadR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.507829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  30.61 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  30.61 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  30.61 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  30.61 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  29.59 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  29 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  30.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0677  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.744991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  37.04 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  30.85 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  28.89 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 111 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 130 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 120 aa  40  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>