More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7159 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1827  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  76.21 
 
 
445 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7159  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
413 aa  841    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7275  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  71 
 
 
431 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  39.15 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  37.23 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.91 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.75 
 
 
426 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.65 
 
 
413 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0831  putative acyl-CoA transferase  41.78 
 
 
429 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150228  normal  0.0178347 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.74 
 
 
418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2771  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.74 
 
 
405 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  39.37 
 
 
413 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2154  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.36 
 
 
413 aa  259  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.575353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  35.55 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.16 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  38.6 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.23 
 
 
411 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.7 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.07 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.69 
 
 
416 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2770  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.16 
 
 
410 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.674174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.97 
 
 
423 aa  250  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3330  formyl-CoA transferase  38.13 
 
 
411 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0442  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.82 
 
 
387 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.32 
 
 
395 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6256  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.83 
 
 
406 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2914  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.71 
 
 
406 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508097  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6415  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.16 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.835321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1258  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.18 
 
 
389 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.534766  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.97 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4272  Formyl-CoA transferase  34.38 
 
 
393 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.45 
 
 
413 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2979  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.22 
 
 
396 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.475368  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8312  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.97 
 
 
425 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1851  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.81 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.990249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1595  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.8 
 
 
390 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4086  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.38 
 
 
390 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  37.41 
 
 
396 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4145  acyl-CoA transferase/L-carnitine dehydratase CaiB  37.91 
 
 
414 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0869104  normal  0.342052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5189  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.34 
 
 
406 aa  239  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0395978  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1831  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.38 
 
 
414 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00867179  normal  0.544825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.08 
 
 
423 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2825  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.4 
 
 
406 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0265401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.64 
 
 
433 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1330  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.2 
 
 
405 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4648  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.72 
 
 
406 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1408  Formyl-CoA transferase  35.29 
 
 
406 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0926  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.29 
 
 
406 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.91 
 
 
395 aa  237  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.440176  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2222  CAIB/BAIF family protein  38.71 
 
 
401 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3203  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.32 
 
 
406 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1386  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.05 
 
 
406 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331191  normal  0.197084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.52 
 
 
407 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3563  Formyl-CoA transferase  33.17 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5950  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.88 
 
 
386 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.64 
 
 
406 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3333  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.7 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  36.91 
 
 
396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4198  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.12 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0473  CAIB/BAIF family protein  37.22 
 
 
401 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4175  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.24 
 
 
406 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0637  CAIB/BAIF family protein  37.22 
 
 
401 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1612  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.14 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1310  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.62 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2812  CAIB/BAIF family protein  37.22 
 
 
401 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1907  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.78 
 
 
452 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.323218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3231  CAIB/BAIF family protein  37.22 
 
 
401 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0207  CAIB/BAIF family protein  37.22 
 
 
401 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1225  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.86 
 
 
382 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0131268  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1385  CAIB/BAIF family protein  37.22 
 
 
401 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.75 
 
 
395 aa  233  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0839  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.23 
 
 
402 aa  233  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00466449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  35.78 
 
 
406 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  35.78 
 
 
406 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  35.77 
 
 
577 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1614  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.15 
 
 
406 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  35.77 
 
 
544 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0954  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.97 
 
 
421 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0829746  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  35.77 
 
 
568 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4552  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.05 
 
 
406 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  35.78 
 
 
406 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0453  CAIB/BAIF family protein  36.97 
 
 
401 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  35.78 
 
 
406 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0062  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.98 
 
 
402 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4517  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.87 
 
 
395 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196524  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4958  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.42 
 
 
399 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0813  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.38 
 
 
406 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.279858  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1449  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.21 
 
 
401 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5111  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.48 
 
 
406 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658987  normal  0.523719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0396  CAIB/BAIF family protein  37.22 
 
 
401 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0281  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.35 
 
 
424 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.16 
 
 
413 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.06 
 
 
416 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3505  Formyl-CoA transferase  36.12 
 
 
411 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16130  hypothetical protein  36.79 
 
 
409 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2662  CAIB/BAIF family protein  35.78 
 
 
406 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.09 
 
 
435 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2227  CAIB/BAIF family protein  35.73 
 
 
412 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3024  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.91 
 
 
416 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05820  hypothetical protein  34.72 
 
 
407 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>