More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4094 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4743  ThiJ/PfpI  98.82 
 
 		 338 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 366 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3423  ThiJ/PfpI domain-containing protein  98.91 
 
 		 366 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  79.51 
 
 		 366 aa  564  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2645  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.79 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2944  ThiJ/PfpI  41.03 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3893  ThiJ/PfpI domain protein  42.72 
 
 		 385 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.69 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4364  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.73 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.51 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  28.53 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.54 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  35.43 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  30.24 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.05 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.08 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.41 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.87 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  33.72 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.25 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  30.98 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  32.54 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  33.75 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  31.86 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  38.93 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  39 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 313 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  27.42 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  32.73 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  29.74 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  40.65 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  37.14 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  38.84 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  43.43 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  32.14 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.52 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.12 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>